Le fonds du chapitre primatial Saint-Jean a été classé entre 1760 et 1769 par Lemoine, feudiste. Il a réparti l'ensemble des documents en plusieurs armoires, portant chacune le nom d'un prophète de l'Ancien Testament. Ces références, auxquelles de nombreux ouvrages renvoient, apparaissent entre crochets au sein des analyses.

La reliure des documents au début du XXe siècle a eu comme conséquence principale, outre la nécessité de plier les documents de grand format, de ne pas pouvoir ranger les documents traitant d'un même sujet dans des cotes voisines à l'occasion du classement. Cela a donc interdit tout aménagement permettant de suivre l'ordre numérique des cotes, en particulier lors du classement méthodique réalisé par Henri Hours à la fin des années 1950.

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Les noms en italique indiquent les actes relatifs à l'entretien de fondations antérieures ; les autres, les titres de fondations eux-mêmes. Bien entendu, on n'oubliera pas, pour tout ce qui concerne ces testaments et fondations, de se reporter aux obituaires de l'Église.

1 : Étienne de Sandrans (vers 1231-1234) ; 2 : Étienne de Rochetaillée (1206) ; 3 : Hugues Ferlaud (1187-1193) ; 6 : Guichard de Marzé (1226) ; 7 : Renaud de Forez (1226) ; 8 : Martin de Viricelle (1226)- 9 : Gérard Viher 1229) ; 5 : confirmation par Renaud de Forez des privilèges des pelletiers de Lyon (1208, copie du XIIIe s.) [Agar I, 1-8].